MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-4 DNA

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020822	ACG	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279654
2	NC_020822	ACT	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279654
3	NC_020822	ATG	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279654
4	NC_020822	A	6	6	657	662	100 %	0 %	0 %	0 %	472279654
5	NC_020822	ACGAA	2	10	704	713	60 %	0 %	20 %	20 %	472279654
6	NC_020822	A	7	7	767	773	100 %	0 %	0 %	0 %	472279654
7	NC_020822	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	472279654
8	NC_020822	GATCA	2	10	824	833	40 %	20 %	20 %	20 %	472279655
9	NC_020822	TCAAG	2	10	841	850	40 %	20 %	20 %	20 %	472279655
10	NC_020822	ATG	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
11	NC_020822	CGGT	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	472279655
12	NC_020822	CGG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279655
13	NC_020822	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279655
14	NC_020822	TCC	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279655
15	NC_020822	CCAAG	2	10	1216	1225	40 %	0 %	20 %	40 %	472279655
16	NC_020822	CGA	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
17	NC_020822	TAA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
18	NC_020822	TGA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
19	NC_020822	CAT	2	6	1417	1422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
20	NC_020822	TAC	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
21	NC_020822	A	6	6	1466	1471	100 %	0 %	0 %	0 %	472279655
22	NC_020822	ATTC	2	8	1486	1493	25 %	50 %	0 %	25 %	472279655
23	NC_020822	T	6	6	1544	1549	0 %	100 %	0 %	0 %	472279655
24	NC_020822	TCA	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
25	NC_020822	AGC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
26	NC_020822	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
27	NC_020822	TG	3	6	2052	2057	0 %	50 %	50 %	0 %	472279656
28	NC_020822	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
29	NC_020822	TTTA	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
30	NC_020822	GAA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279656
31	NC_020822	A	7	7	2326	2332	100 %	0 %	0 %	0 %	472279656
32	NC_020822	TGAT	2	8	2409	2416	25 %	50 %	25 %	0 %	472279656
33	NC_020822	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
34	NC_020822	AAT	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
35	NC_020822	TGA	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
36	NC_020822	GAT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
37	NC_020822	A	6	6	2513	2518	100 %	0 %	0 %	0 %	472279656
38	NC_020822	ATA	2	6	2538	2543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
39	NC_020822	TCA	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279656
40	NC_020822	CTC	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279656
41	NC_020822	AT	3	6	2625	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	472279656
42	NC_020822	TCTA	2	8	2640	2647	25 %	50 %	0 %	25 %	472279656
43	NC_020822	ATTT	2	8	2657	2664	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
44	NC_020822	GAT	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
45	NC_020822	TATT	2	8	2727	2734	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
46	NC_020822	TAA	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
47	NC_020822	AT	3	6	2805	2810	50 %	50 %	0 %	0 %	472279656
48	NC_020822	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
49	NC_020822	A	6	6	3107	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	472279657
50	NC_020822	AAC	2	6	3175	3180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
51	NC_020822	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
52	NC_020822	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
53	NC_020822	CAG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
54	NC_020822	GAT	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279657
55	NC_020822	GAC	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
56	NC_020822	AGC	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279658
57	NC_020822	CT	3	6	3808	3813	0 %	50 %	0 %	50 %	472279658
58	NC_020822	ATGG	2	8	3861	3868	25 %	25 %	50 %	0 %	472279658
59	NC_020822	ATC	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279658
60	NC_020822	CTCG	2	8	4044	4051	0 %	25 %	25 %	50 %	472279658
61	NC_020822	T	6	6	4177	4182	0 %	100 %	0 %	0 %	472279658
62	NC_020822	GCG	2	6	4219	4224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279658
63	NC_020822	GAA	2	6	4405	4410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279658
64	NC_020822	GCC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279658
65	NC_020822	AATC	2	8	4521	4528	50 %	25 %	0 %	25 %	472279658
66	NC_020822	GGT	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279658
67	NC_020822	GTT	2	6	4659	4664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279658
68	NC_020822	ACT	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279659
69	NC_020822	TAAG	2	8	4793	4800	50 %	25 %	25 %	0 %	472279659
70	NC_020822	GAGC	2	8	4841	4848	25 %	0 %	50 %	25 %	472279659
71	NC_020822	TTC	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279659
72	NC_020822	GAA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279659
73	NC_020822	TCAA	2	8	4903	4910	50 %	25 %	0 %	25 %	472279659
74	NC_020822	GCT	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279659
75	NC_020822	ATA	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279659
76	NC_020822	TTGA	2	8	5051	5058	25 %	50 %	25 %	0 %	472279659
77	NC_020822	ACC	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279659
78	NC_020822	GTA	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
79	NC_020822	GA	3	6	6160	6165	50 %	0 %	50 %	0 %	472279660
80	NC_020822	GAA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
81	NC_020822	CAA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279660
82	NC_020822	GTC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279660
83	NC_020822	GAT	2	6	6400	6405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
84	NC_020822	TCA	2	6	6449	6454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279660
85	NC_020822	TCT	2	6	6552	6557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
86	NC_020822	GCG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279660
87	NC_020822	CTT	2	6	6607	6612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
88	NC_020822	TGT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279660
89	NC_020822	AGC	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279660
90	NC_020822	CG	3	6	6735	6740	0 %	0 %	50 %	50 %	472279660
91	NC_020822	GAA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
92	NC_020822	TCGAG	2	10	6882	6891	20 %	20 %	40 %	20 %	472279660
93	NC_020822	ATT	2	6	7473	7478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279661
94	NC_020822	A	7	7	7564	7570	100 %	0 %	0 %	0 %	472279661
95	NC_020822	T	6	6	7572	7577	0 %	100 %	0 %	0 %	472279661
96	NC_020822	GTTGA	2	10	7599	7608	20 %	40 %	40 %	0 %	472279661
97	NC_020822	T	6	6	7643	7648	0 %	100 %	0 %	0 %	472279661
98	NC_020822	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279661
99	NC_020822	GTA	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279661
100	NC_020822	TTTG	2	8	7711	7718	0 %	75 %	25 %	0 %	472279661
101	NC_020822	AGA	2	6	7729	7734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279661
102	NC_020822	TGGGGC	2	12	7751	7762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	472279661
103	NC_020822	ATT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279661
104	NC_020822	CCA	2	6	7818	7823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279661
105	NC_020822	AAT	2	6	7841	7846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279661
106	NC_020822	ATT	2	6	7875	7880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279662
107	NC_020822	T	7	7	7879	7885	0 %	100 %	0 %	0 %	472279662
108	NC_020822	TTTC	2	8	7969	7976	0 %	75 %	0 %	25 %	472279662
109	NC_020822	TTC	3	9	7982	7990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279662
110	NC_020822	TA	3	6	8102	8107	50 %	50 %	0 %	0 %	472279662
111	NC_020822	CAAAT	2	10	8219	8228	60 %	20 %	0 %	20 %	472279662
112	NC_020822	ATT	2	6	8297	8302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279662
113	NC_020822	T	7	7	8310	8316	0 %	100 %	0 %	0 %	472279662
114	NC_020822	CTT	2	6	8407	8412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279662
115	NC_020822	GCAA	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	472279662
116	NC_020822	ATC	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279662
117	NC_020822	T	7	7	8527	8533	0 %	100 %	0 %	0 %	472279662
118	NC_020822	TGT	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279662
119	NC_020822	CAA	2	6	9080	9085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279663
120	NC_020822	GTG	2	6	9104	9109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
121	NC_020822	GGT	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
122	NC_020822	AACA	2	8	9187	9194	75 %	0 %	0 %	25 %	472279663
123	NC_020822	T	6	6	9226	9231	0 %	100 %	0 %	0 %	472279663
124	NC_020822	GTG	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279663
125	NC_020822	ATT	2	6	9617	9622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279664
126	NC_020822	GTG	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279664
127	NC_020822	GAG	2	6	9655	9660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472279664
128	NC_020822	A	6	6	9669	9674	100 %	0 %	0 %	0 %	472279664
129	NC_020822	GCG	2	6	10068	10073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279665
130	NC_020822	TGA	3	9	10149	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279665
131	NC_020822	AAG	2	6	10209	10214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279665
132	NC_020822	TGG	2	6	10282	10287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279665
133	NC_020822	GAA	3	9	10327	10335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279665
134	NC_020822	TAC	2	6	10366	10371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279665
135	NC_020822	GAT	2	6	10678	10683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279666
136	NC_020822	TTG	2	6	10751	10756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279666
137	NC_020822	GAA	3	9	10792	10800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279666
138	NC_020822	TCG	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279667
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141	NC_020822	TAT	2	6	11054	11059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279667
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261	NC_020822	T	6	6	18171	18176	0 %	100 %	0 %	0 %	472279673
262	NC_020822	TGA	2	6	18238	18243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279673
263	NC_020822	GTT	2	6	18299	18304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279673
264	NC_020822	TAC	3	9	18323	18331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279673
265	NC_020822	AGAT	2	8	18375	18382	50 %	25 %	25 %	0 %	472279673
266	NC_020822	ATC	2	6	18423	18428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279673
267	NC_020822	GTC	2	6	18628	18633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279673
268	NC_020822	A	6	6	18659	18664	100 %	0 %	0 %	0 %	472279673
269	NC_020822	TAA	2	6	18672	18677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279673
270	NC_020822	TGT	2	6	18762	18767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279673
271	NC_020822	T	6	6	18767	18772	0 %	100 %	0 %	0 %	472279673
272	NC_020822	GCC	2	6	18834	18839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279674
273	NC_020822	GCT	2	6	18920	18925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
274	NC_020822	ATG	2	6	18955	18960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279674
275	NC_020822	TCA	2	6	18965	18970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279674
276	NC_020822	GT	3	6	18980	18985	0 %	50 %	50 %	0 %	472279674
277	NC_020822	GCT	2	6	19007	19012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
278	NC_020822	GTC	2	6	19040	19045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
279	NC_020822	T	7	7	19047	19053	0 %	100 %	0 %	0 %	472279674
280	NC_020822	CCA	2	6	19080	19085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279674
281	NC_020822	TTG	2	6	19150	19155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279674
282	NC_020822	AATT	2	8	19180	19187	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
283	NC_020822	GTTGCG	2	12	19194	19205	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	472279674
284	NC_020822	TTG	2	6	19297	19302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279674
285	NC_020822	TCA	2	6	19307	19312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279674
286	NC_020822	AATT	2	8	19324	19331	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
287	NC_020822	ATAATC	2	12	19339	19350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472279674
288	NC_020822	GAC	2	6	19357	19362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279674
289	NC_020822	CCG	2	6	19434	19439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279674
290	NC_020822	TTG	2	6	19552	19557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279674
291	NC_020822	GCC	2	6	19619	19624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279674
292	NC_020822	CCA	2	6	19653	19658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279674
293	NC_020822	CTG	2	6	19684	19689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
294	NC_020822	ATG	2	6	19703	19708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279674
295	NC_020822	TA	3	6	19731	19736	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
296	NC_020822	CTT	2	6	19800	19805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279674
297	NC_020822	CAA	2	6	19881	19886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
298	NC_020822	TAA	2	6	19921	19926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279674
299	NC_020822	CAC	2	6	19933	19938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279674
300	NC_020822	AATT	2	8	19947	19954	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
301	NC_020822	AGC	2	6	19996	20001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279674
302	NC_020822	CTG	2	6	20062	20067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
303	NC_020822	TGG	2	6	20085	20090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279674
304	NC_020822	AGT	2	6	20185	20190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279674
305	NC_020822	ATA	2	6	20215	20220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279674
306	NC_020822	TGG	2	6	20244	20249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279674
307	NC_020822	AT	3	6	20309	20314	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
308	NC_020822	AAC	2	6	20317	20322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
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313	NC_020822	TCA	2	6	20423	20428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279674
314	NC_020822	CAG	2	6	20437	20442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279674
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331	NC_020822	T	7	7	21484	21490	0 %	100 %	0 %	0 %	472279674
332	NC_020822	ATTA	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
333	NC_020822	ACC	2	6	21619	21624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279674
334	NC_020822	AAC	2	6	21644	21649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
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340	NC_020822	AAC	2	6	21928	21933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
341	NC_020822	AGA	2	6	22503	22508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279675
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345	NC_020822	T	6	6	22835	22840	0 %	100 %	0 %	0 %	472279675
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349	NC_020822	GCA	2	6	22955	22960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279675
350	NC_020822	TGA	2	6	22979	22984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
351	NC_020822	TTG	2	6	23053	23058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279675
352	NC_020822	TC	3	6	23095	23100	0 %	50 %	0 %	50 %	472279675
353	NC_020822	ATG	2	6	23118	23123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
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362	NC_020822	A	8	8	23917	23924	100 %	0 %	0 %	0 %	472279677
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369	NC_020822	AAT	2	6	24306	24311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279678
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373	NC_020822	GCT	2	6	24552	24557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279678
374	NC_020822	GC	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	472279678
375	NC_020822	AAT	2	6	24612	24617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279678
376	NC_020822	GCT	2	6	24637	24642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279678
377	NC_020822	TGT	2	6	24682	24687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279678
378	NC_020822	GGT	2	6	24875	24880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279678
379	NC_020822	GC	3	6	24920	24925	0 %	0 %	50 %	50 %	472279678
380	NC_020822	GCC	2	6	24952	24957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279678
381	NC_020822	TCA	2	6	24984	24989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678
382	NC_020822	TGA	2	6	25026	25031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279678
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384	NC_020822	CCA	2	6	25188	25193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279678
385	NC_020822	AAG	2	6	25296	25301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279678
386	NC_020822	TCA	3	9	25317	25325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678
387	NC_020822	A	6	6	25325	25330	100 %	0 %	0 %	0 %	472279678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.